喝柠檬菊花茶后发烧可能是由于以下几个原因：
1. 过敏反应：柠檬和菊花都是常见的过敏原，有些人对其过敏，饮用柠檬菊花茶后可能会引起过敏反应，出现发烧、红肿、瘙痒等症状。过敏反应是机体对外界刺激的异常敏感反应，会导致免疫系统异常反应，从而引起发烧等症状。
2. 饮用方式不当：在制作柠檬菊花茶时，如果使用了不干净的柠檬或菊花，或者存放不当导致茶水受到了细菌或病毒的污染，就会引起发烧等症状。此外，如果柠檬菊花茶冷却后再次加热重新饮用，也可能会导致细菌繁殖，引发发烧。
3. 反应不当：有些人在饮用柠檬菊花茶时可能会出现身体不适的反应，比如肠胃不适、头晕等症状，如果没有及时调整饮食或休息，可能会引起发烧。此外，柠檬菊花茶中含有一定的挥发性油和芳香性物质，有些人可能对其反应敏感，导致发烧等症状。
4. 柠檬菊花茶可能会影响药物代谢：柠檬菊花茶中含有丰富的维生素C和花青素等成分，这些成分可能会影响药物的代谢和吸收，导致某些药物在体内浓度过高，从而引起不良反应或发烧等症状。
总的来说，喝柠檬菊花茶后发烧可能是因为过敏反应、饮用方式不当、反应不当或药物相互作用等原因引起的。如果出现发烧等不适症状，建议及时停止饮用柠檬菊花茶，并咨询医生进行诊断和治疗。在日常饮用茶水时，应选择新鲜干净的食材进行制作，注意饮用方式和饮食调节，以避免不适反应的发生。
